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在轨饲养5到7天后，小鼠将随神舟二十号载人飞船返回地面，供科研团队开展进一步科学研究。科研人员将在酒泉卫星发射中心对小鼠进行外观检查、行为学测试和解剖，并建立“样本的身份证系统”，从样本取出那刻起，怎么标记、保存、运输，每个环节都有严格记录，确保每一份组织样本都能追溯到来自哪只小鼠和具体时间点。
中国科学院空间应用工程与技术中心是中国载人航天工程空间应用系统总体单位，代表中国科学院牵头负责空间应用系统。这次将重点开展的6项研究包括：“空间动物品系筛选与饲养关键技术验证”“空间环境下遗传密码起源与手性的关系”等3项生命科学领域研究；“微重力环境下活性胶体的结构与动力学研究”等2项流体科学领域研究；搭载开展“面向空间应用的锂离子电池电化学光学原位研究”空间材料科学领域研究，由载荷专家在轨实施。
由中国科学院上海技术物理研究所、中国科学院动物研究所负责的“空间动物品系筛选与饲养关键技术验证”项目，首次将哺乳动物小鼠送入中国空间站，在轨期间通过多维度视频图像监测小鼠空间行为，研究失重、密闭等空间条件对小鼠行为模式的影响，从而掌握空间小型哺乳动物饲养和监测关键核心技术，并初步探究小鼠在空间环境的应激响应和适应性变化规律。
由上海交通大学牵头的“微重力环境下活性胶体的结构与动力学研究”项目，针对地面实验中难以消除重力影响的核心问题，拟在不同驱动力强度与颗粒浓度条件下，系统研究活性胶体的集群结构与动力学行为，揭示活性胶体粒子的个体运动特征与集体演化规律，阐明其在微重力环境下的驱动机制、相互作用与自组织原理。相关研究成果有望为微纳机器人叁维集群控制、新型智能响应与自修复材料的设计提供理论依据与实验基础。
3.5小时交会对接如何实现？据悉，交会对接通常分为远程导引和近程导引两个阶段。前者通过数次轨道控制发动机点火，将飞船引导至空间站后下方几公里至几十公里的既定“等待区”。随后，飞船进入近程导引阶段，启动更为灵敏的控制发动机，对自身轨道和姿态进行精细调整，以稳定的相对速度，逐步逼近空间站，直至对接机构能够捕获并锁紧。
“驾驭”飞船完成交会对接的是制导、导航与控制(骋狈颁)系统。它掌控着飞船从与火箭分离、入轨开始，到与空间站交会对接，以及未来离开空间站、返回着陆的全过程，被誉为飞船的“智慧大脑”与“舵手”。每一个轨道调整指令的生成、每一次姿态的微调恐龙帝国下载，都源于它对海量数据的瞬间处理与精准决策。通过开关设置恐龙帝国下载，骋狈颁系统可在3.5小时和其他交会对接模式之间切换。任务期间，飞船会在入轨后评估判断自身状态，从而决定交会对接方案。
据中国载人航天工程办公室消息，在载人飞船与空间站组合体成功实现自主快速交会对接后，神舟二十一号航天员乘组从飞船返回舱进入轨道舱。北京时间2025年11月1日4时58分，在轨执行任务的神舟二十号航天员乘组顺利打开“家门”，欢迎远道而来的神舟二十一号航天员乘组入驻中国空间站，这是中国航天史上第7次“太空会师”。两名指令长继叁年前首次“太空会师”后再度相聚“天宫”。随后，两个航天员乘组拍下“全家福”，共同向牵挂他们的全国人民报平安。
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